煮鸡蛋蛋黄流心是否能吃应视具体情况而定。若为无菌蛋，即严格使用巴氏消毒法杀菌消毒过的鸡蛋，通常含细菌较少，虽然无法彻底将所有细菌杀灭，但相对较为安全。因此煮无菌蛋蛋黄流心一般认为能吃，不会对人体造成特殊危害，但应注意适量食用。
若为普通鸡蛋，煮鸡蛋蛋黄流心则不能吃。因为未经严格消毒的普通鸡蛋很容易被沙门菌、霉菌等细菌感染，甚至会有寄生虫虫卵等有害物质。若吃蛋黄流心，即没有完全煮熟的鸡蛋，可能会导致有害物质进入体内，较易引发恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道感染症状，严重时甚至可导致寄生虫感染，发生肠炎、胃炎等疾病，不利于人体健康。
因此建议在日常生活中尽量将鸡蛋烹制全熟后食用，可适量食用蛋黄流心的无菌蛋，但要避免食用蛋黄流心的普通鸡蛋，除了可能导致身体不适外，还会阻碍人体对鸡蛋中蛋白质、氨基酸等营养物的消化吸收。